Если файл открыт в браузере, но кнопок не видно:
2. Через контекстное меню (Правой кнопкой мыши)
Если PDF открыт прямо в браузере (Google Chrome, Яндекс.Браузер, Microsoft Edge):
1. С помощью кнопки «Скачать» (Download)
Если файл представлен в виде ссылки на странице:
, если под словом «paper» вы имели в виду конкретную программу или специфическую научную базу данных — я подскажу более точный алгоритм.